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Thonon Culture Collection TCC

UMR Carrtel

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27 octobre 2023

Rédaction : Isabelle Huguet

Actualités

Sept 2023: Which barcode to decipher freshwater microalgal assemblages? Tests on mock communities by A. Canino
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Les objectifs de la collection

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Les principaux objectifs de la collection sont d'assurer la conservation de cultures et d'échantillons de microalgues d'eau douce et leur accessibilité pour :

Barcoding de la collection

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Les données moléculaires de la collection sont disponibles sur Diat.barcode

Autres collections françaises de microalgues

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Ci-après voici quelques sites de collections françaises de cultures de microalgues :

Edito

  • La TCC fait parti :
    • de OLA https://internet6-national-soere-ola.hub.inrae.fr/
      • Publication OLA: Rimet F, Anneville O, Barbet D, Chardon C, Crépin L, Domaizon I, Dorioz J-M, Espinat L, Frossard V, Guillard J, Goulon C, Hamelet V, Hustache J-C, Jacquet S, Lainé L, Montuelle B, Perney P, Quetin P, Rasconi S, Schellenberger A, Tran-Khac V, Monet G. The Observatory on LAkes (OLA) database: Sixty years of environmental data accessible to the public: The Observatory on LAkes (OLA) database. J Limnol [Internet]. 2020 Feb. 27 [cited 2021 Aug. 24];79(2). Available from: https://www.jlimnol.it/index.php/jlimnol/article/view/jlimnol.2020.1944 
    • du BRC4Env, le réseau des Centres de Ressources Biologiques pour l'Environnement. Il a pour but de stocker et fournir des ressources environnementales (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. Le BRC4Env est l'un des piliers de l'infrastructure nationale française "Ressources Agronomique pour la Recherche" (AgroBRC-RARe). La présentation du BRC4Env est publiée: 
      • Mougin, C., Artige, E., Marchand, F., Mondy, S., Ratié, C., Sellier, N., Castagnone, P., Coeur D'Acier, A., Esmenjaud, D., Faivre-Primot, C., Granjon, L., Hamelet, V., Lange, F., Pages, S., Rimet, F., Ris, N., Salle, G. (2018). BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for research in environmental and agricultural sciences. Environmental Science and Pollution Research. DOI : 10.1007/s11356-018-1973-7    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11356-018-1973-7
  • Les différentes cultures de la TCC sont séquencées, les données sont disponibles sur Diat.barcode 
  • Les données de séquences sont aussi disponibles via le réseau R-SYST. R-SYST est un réseau national d'une douzaine d'équipes de recherche INRA qui étudient la caractérisation moléculaire et morphologique d'organismes.
  • La TCC est enregistrée à la WDCM : WDCM 1030
  • La TCC est enregistrée au Global Registry of Biorepositories http://grbio.org/institution/thonon-culture-collection-umr-carrtel-inra
  • Citation de la collection:
    • Rimet, Frédéric; Chardon, Cécile; Lainé, Leslie; Bouchez, Agnès; Domaizon, Isabelle; Guillard, Jean; Jacquet, Stéphan, 2018, "Thonon Culture Collection -TCC- a freshwater microalgae collection", https://doi.org/10.15454/UQEMVW, Portail Data Inra, V1
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